尤莉安公主,与爱迪和梦比优斯交手,挡下了爱迪和梦比优斯的光线,并与两位奥特曼对决不分胜负。后对战泰迦三重斯特利姆形态和泽塔,被泰迦与泽塔巧妙配合重创后再次召唤杰顿军团之际被泰迦使用彩虹斯特利姆爆裂连同其他杰顿军团彻底消灭。
恐魔人杰特的失败,让百特星人意识到,杰顿只是适合作为生物兵器,即便是赋予了心,也完全玩不过那些靠着唯心各种秒天秒地的奥特战士。他认真的思考了以后,发现还是由自己控制的超完全体的海帕杰顿更有胜率一些。
宇宙恐龙海帕杰顿是由百特星人创造的究极生物兵器,结合了杰顿的优秀部分,未完全体之时就曾毁灭了比特之星所在的宇宙。海帕杰顿以宇宙球体斯菲亚以及各种怪兽为食,吸收人类的绝望与悲鸣,是恐怖和绝望的化身,被称作宇宙的破坏神。其完全体直接被称为能主宰所有宇宙,为所有宇宙带来死亡的死神,也是钦点的史上最强怪兽,直到现在也未曾动摇。
故事开始时,赛罗正在消灭剩余的贝利亚军团。之后,听到了飞鸟的声音,于是他马上就来到了地球。
穿越时空时,赛罗奥特曼的父亲赛文奥特曼第一时间感应到了赛罗。之后,斯菲亚袭击了SUPER GUTS的火星移民基地,但是此次驾驶阿尔法号出去迎击怪兽的就是赛罗奥特曼新人间体·大河望。
赛罗奥特曼到达地球后,先后击落了三架为百特星人护航的战斗机,并被为了救小武而不顾生命的大河望感动,与他合为一体。
正当大河和武藏两人见面时,被突然出现的Team-U队长杏奈带去了地球防卫队,并被告知这个世界的现状。好景不长,百特星人重新派出了古维拉和哥美斯S,这使变身后的武藏陷入了苦战。
最后,赛罗和高斯即将胜利之时,百特星人的圆盘突然出现,将两只怪兽消灭,这才得知,地球被百特星人选做了实验的场地。
第二天,百特星人再次现身,并放出了影像,众人才得知原来戴拿为了封印海帕杰顿耗尽了全部能量,变为了石像,而这时的海帕杰顿也已经破除封印而觉醒了。
正当大河懊悔之时,赛罗劝说大河,使得大河终于变身成为了赛罗奥特曼。U队的队员和小武找到闪光剑(戴拿奥特曼的变身器)之后,将它交给了杏奈队长。赛罗、高斯、戴拿三人消灭掉了芝顿幼体之后,才发现战斗并没有结束,后面即将面对的是更为棘手的对手:完全体超级芝顿。
他们三人很快被超级芝顿打败后,大河爬起来,发现赛罗的帕拉吉手镯变成了石头,飞鸟走过来说:不要放弃,超越极限的时候,能看到新的东西!武藏也鼓励他,三人站起大喊“真正的战斗,从此刻开始!”他们驱动了帕拉吉手镯,变成了更强的赛迦气息的赛迦奥特曼。
大河、飞鸟、武藏三人也因此合体变身成最强的战士——赛迦奥特曼。
经过一番激战,他们终于击败了海帕杰顿和百特星人,使得地球恢复了原本和平安定的日子。
之后,高斯回到了行星朱兰,戴拿也继续各个时空的旅程,大河选择留在这颗被三位传说的英雄们拯救的地球,亲眼见证它的未来,开始了新的生活。赛罗也离开了大河,回到了光之国。